中央空調冷卻水系統具有一定的腐蝕性，容易堵塞風機盤管，容易造成相關附件的損壞，從而影響到了系統的正常運行。在清洗和維護過程中需要注意的地方不少。
1 中央空調水處理系統運行前清洗
在中央空調水處理系統運行之前，是需要對水系統進行清洗的，這樣能去除掉安裝過程中產生的焊渣、油污等。在清洗冷媒水系統干管時，應先關閉冷源機組蒸發器、風柜和風機盤管的進水閥，開啟旁通閥，使污水通過旁通閥排出管外。蒸發器、風柜和風機盤管的清洗需單獨進行。
2 中央空調水處理系統運行中清洗
中央空調水系統在運行過程中，通常是需要一周到兩周就應該對水質進行監測，調整PH值在規定范圍內（6~8），將冷卻水的濃縮倍數控制在2.5~3.5左右，同時，應及時對系統進行排污和補水。
3 中央空調水處理系統停機后清洗
中央空調水處理系統在停機之后，是需要將冷卻水全部放掉，對于冷媒水，若水質若符合要求，可以不放掉，但是若是在冬季停機，為防止管道凍裂，則需將系統中的水全部放掉。放水后應對除污器和過濾網等進行清洗。冷卻水沖洗的速度和溫度要控制好了，這樣不僅能抑.制細.菌滋生，而且還能減少水垢的發生。
中央空調水處理系統的清洗工作做完之后，能將空調當中細J沖洗干凈，減少細J傳染，同時還能讓設備更為干凈，運行起來輕便，減少耗電量，延長設備的使用時間，減少故障，節省維修費用。